عادةً ما يُجرى تجميد الأجنة كجزء من علاج الزوجين العقيمين، بعد عمليات التلقيح الصناعي (IVF) أو الحقن المجهري (ICSI).
في الماضي، كان يتم تجميد الأجنة في حال وجود عدد كبير من البويضات وتكوّن عدة أجنة، أو لأسباب مثل عدم ملاءمة الرحم أو احتمال حدوث متلازمة فرط التحفيز، ليتم استخدامها لاحقًا. أما اليوم، فقد أظهرت الدراسات أن فرص الحمل باستخدام الأجنة المجمدة أعلى من الأجنة الطازجة، لذا يتم تجميد الغالبية العظمى من الأجنة الناتجة عن IVF أو ICSI ونقلها إلى الرحم في الأشهر التالية.
يُعد تجميد الأجنة أيضًا أحد أفضل طرق حفظ الخصوبة، ويوصى به بشدة للزوجين الراغبين في تأجيل الإنجاب لأسباب اقتصادية، مهنية، تعليمية أو صحية، مثل مرض السرطان.
في عملية تجميد الأجنة، تُجمّد البويضات المخصبة في اليوم الثالث أو الخامس بعد التلقيح لاستخدامها في المستقبل.